馬總統如若還堅持公理、正義、法制、原則， 就應該接受中央研究院海內外院士的連署建議，讓全體院士會議研議及制訂中研院院長遴選辦法，讓未來的中研院再恢復像以前那樣一個單純的、崇高的、不受政治與金錢污染的學術機構。

中研院在經歷了李遠哲和翁啟惠這兩任院長之後，已沾染了醜陋的政治與金錢關係，李遠哲支持貪腐的陳水扁與翁啟惠跟蔡英文不清不楚的利益糾葛，已使中研院不再是一個獨立的崇高學術研究機構，充分說明整頓、清理這個機構的工作已刻不容緩，不能再拖延下去了。

馬總統應該接受中研院院士、美國普林斯頓大學退休教授項武忠發起的連署主張是有道理的: 首先，那是不分藍綠 40多位院士的建議，符合中研院的中立超然立場；

這次推出新院長人選的中研院評議會中有一半不是院士，而世界各國像這樣的學術科研機構，例如美國國家科學研究院，都是由院士推選院長。台灣各大學都已開始由教授推舉校長治校，像中研院這樣的學術機構更應該尊重院士對遴選院長的意見；

更讓人非議的是這次遴選中研院院長的程序出現了瑕疵，如院士曾志朗所言，評議會未經深入討論，就匆匆進行投票，在多數與會者措手不及的情況之下，推出了三位候選人；

中研院院士、台大醫學院臨床研究所教授陳培哲指出，這次遴選院長顯見有一群特定的圈內人，一直企圖掌握中研院的權力與資源，他沒有明說，但有人指出，李遠哲力挺中研院院士、美國加州大學洛杉磯分校化學及生物分子工程主任廖俊智，讓他成為得票最高者，並且透過放話，企圖逼迫馬總統圈選廖俊智出任新院長；

項武忠點明，李遠哲、翁啟惠和廖俊智都出身化學分子部門，如此不避諱地企圖長期控制中研院，顯見不符公正不偏的原則；

有學界人士表示，這次參加連署，請馬總統退還中研院評議會送交總統府的候選人名單的院士以海外院士占多數，國內院士較少，這不難理解，因為學術界人士本來就不喜歡介入這種紛爭事件，加以他們在國內已或多或少沾染了鄉愿習氣，不肯得罪人；

有國內院士表示反對這項連署建議，理由是：三位候選人是經正當程序選出來的，雖然中研院院士、香港城市大學校長郭位已致函中研院，要求不要將他列名候選人送請馬總統圈選，但既已照程序產生候選人，就不宜撤回，顯得不尊重程序，但他沒有弄清楚，在有瑕疵的程序中推出的候選人本來就有問題，重新讓所有院士來推選新院長，才符合尊重學術自主、遵行民主與公義的原則；

總統府是中研院的上級機關，馬總統依照憲法有權力圈選中研院院長，當然也有權力決定中研院是否應該由全體院士公開、公正地推舉新院長。

另方面，馬總統可以不准翁啟惠擺爛請長假，他同樣可將翁啟惠停職，靜候司法檢調機構弄清楚翁啟惠在浩鼎案中是否涉及科技移轉圖利與股票內線交易等罪責。 前新聞局官員郭冠英只不過用筆名寫文章冒犯了一些人，說停職就被停職了，且一停就是三年，搞得他最後連賴以養老的退休金都拿不到，翁啟惠只不過官大了些，人格不見得比郭冠英高尚，涉及浩鼎案的罪嫌比郭冠英事件的情節嚴重多了，他卻可以賴著不辭，甚至不理會立法院育及文化委員會通過要求他立即辭職的決議案，難道是因為他有蔡英文當靠山 ？難道是因為圈內有人撐腰 ？ 如此說來，讓人不禁要替郭冠英叫屈，嘆這世道不公平。

翁啟惠日前在立法院教育及文化委員會答覆之委何欣純質詢時，竟然說：“科學家本來就不正常”，如此厚顏耍賴，在國會殿堂上信口爛言，把中研院的清譽都毀了，早就不適合繼續擔任中研院長了，難道學術界還看得下去 ？