就煉丹的體驗，或有不同，參研古來聖賢丹經所述，宋元以後內丹家將丹道系統化，而有「丹」的存在。古印度的瑜珈及藏密的拙火瑜珈文獻中，並沒有「丹」的論點，藏密與古印度對於人身正中有重要的四輪之說，甚至後來又發展成為「七重輪」，實際上古文獻僅有四脈輪的論點，這四輪各分佈頭、喉、心、臍處，與道家內丹學所述的上中下丹田位置，巧妙的似乎有重疊符合之處，唯多了個喉輪。

論內丹陽神說，藏密拙火瑜珈也有「幻身」的說法，亦有「清凈幻身」與「不淨幻身」的論點，幻身有可能就是仙道所說的陽神，道家在這裡亦分「陽神」與「陰神」，其中分別與藏密系統頗有異曲同工之處，皆認為不純淨的「神識」，須再經練化而成清凈本質的純陽體。

「丹」的本體有可能只是顆氣團光珠，並非實體，甚而近代內丹學者多引述為實體的丹球，試想體內真氣乃流竄不止，如何停留身中一處成丹球？南懷僅先生亦述，身中內氣如吹鼓氣球，氣球內的空氣也是流動不已怎能集中一處。因此雲仙體驗之見，「丹」確實存在，也如古云，古丹經多是隱喻為金丹一顆，實際是顆氣狀能量球，內視成象，根據丹經所述結丹之處多在下丹田處，結丹過程會有感覺一顆直徑三公分乒乓球大小的小圓球繞著神厥穴呈旋轉狀後復歸，此時下半身會瞬間產生超越性愛數倍的無比快感與觸電麻感，陰莖與睪丸此刻強力內縮腹中，此時尚稱小藥，而大藥階段閉眼玄關處則會看見一黑一黃兩股氣光交抱旋轉猶如太極雙魚運轉，此乃道家煉丹玄妙之處。這種小藥的出現感覺並非刻意「存思」而成，也就是並非觀想做作而成，而是自然產生的現象。

雲仙曾內視下丹田的結構，下半身的諸多氣脈確實匯聚於此處臍輪，練氣結果使得這些氣脈的內氣匯聚在一塊，內氣互相推擠形成一旋轉圓球，直至停止運轉，之後所呈現是下腹不時泛出光芒上射眼簾。

張紫陽真人於《悟真篇》云：『要得穀神長不死，須憑玄牝立根基。真精既返黃金室，一顆【明珠】永不離。』

北派全真王重陽於《五篇靈文》曰：『金丹在內，藥從外來，實由內孕也。蓋神依形生，既有此物……一點先天在人身，箇箇不無，人人本有。一念不生，靜中至寂，忽然天光自發，不內不外之間，若有一物，或明或隱，乃玄珠成象。玄珠因何而成象？皆因靜寂之時，神抱於氣，氣結精凝，結成一粒金丹，永在丹田之內；外現玄境之象，【猶如室內之燈光，照透窗外之明朗】。天根月窟閒來往，三十六宮都是春，待他一點自歸復，身中化作四時春。溫養丹鼎，光透簾幃，此之謂玄珠外藥也。』

《修仙辯惑論》陳泥丸云：『殊不知終日談演問答乃是干慧，長年枯兀昏沉乃是頑空。然天仙之學，如水精盤中之珠，轉漉漉地，活潑潑地，自然【圓陀陀光爍爍】。所謂天仙者，此乃金仙也，夫此不可言傳之妙也。人誰知之？人誰行之？人若曉得金剛、圓覺二經，則金丹之義自明，何必分別老釋之異同哉？天下無二道，聖人無兩心，何況人人具足，個個圓成』

由此而知從古仙所著丹經看來，丹的實體其實是光珠一顆，不是靠觀想於該處集中心念產生的感覺而有，靠這種虛假方式結丹實非真丹。一旦沒有觀想丹不就又幻滅不在了，真實結丹並不需要靠觀想，自然於行住坐臥都是一直存在著不會消失，閉眼亦可視下丹田泛光。

至於還丹的過程，大藥與小藥在柳華陽真人所著的丹經提及皆為同一物，不過差別在於能量大小，還丹大藥則復結於中丹田。雲仙體驗小藥是下丹田臍處的能量球發展極至的成果。後再往上進入中丹田的心輪將全身氣脈內氣又匯聚此處，所不同的是心輪中丹田的能量匯聚並沒有如同下丹田的能量球旋轉情形產生，卻是如同星雲漩渦狀的自轉，所有內氣匯集而呈漩渦狀流動的光團，所泛出的光甚至能擴散到身外，身體外圍形成一個大的圓光。

近代內丹家許進忠先生於《築基參證》一書所著結丹過程與徵相，為近代修仙道人士的參考丹經。結丹會有溫熱感、快感、光感三者俱足方是驗證。