柯文哲在台北市長任內曾多次參與保育類動物相關活動，如2016年見證北高動物園合作保育侏儒河馬與白犀牛，並於2022年虎年到動物園為石虎、蜂虎等動物加菜。他也曾被現場考驗保育知識，對答如流，並曾關注狒狒事件揭露的法規灰色地帶。
以下是柯文哲參與的相關保育活動與觀點：
動物園借殖與交流： 2016年，在台北市長柯文哲與高雄市長陳菊的見證下，台北市立動物園與高雄壽山動物園簽署合作備忘錄，將侏儒河馬、白犀牛、伊蘭羚羊及北非髯羊等珍稀動物進行交流與保種。