詹素娟老師的族群史研究，以臺北凱達格蘭族 (Ketagalan)、宜蘭與花東的噶瑪蘭族 (Kavalan)、四溪流域（頭前、鳳山、後龍、中港）的客家族群與原住民等為研究重心。

詹老師大學時代參加山地服務隊，每年寒、暑假都會去花蓮縣卓溪鄉布農族與泰雅族混居的村落。她說：「那時我帶著很純粹、年輕人的熱情去那些地方，但對於原住民為什麼會住在那裡？一個村子裡為什麼會有泰雅族與布農族混居等現象，一無所知。我沒有修過臺灣史的課，也沒有任何基本的知識，但這顆關懷族群議題的種子，就是會放在那樣一個小孩子時期的心裡。」

選擇碩士論文題目時，詹老師決意從事邊緣、族群、異文化分析的研究。原本計畫研究新疆或中國東北地區，但受到當時環境與材料的限制，便轉做臺灣史研究。一開始，詹老師使用連橫的說法，以「漢番關係」詮釋平埔族和漢人的歷史，但在接觸到人類學的材料與觀點後，詹老師開始有了原住民主體性的想法，而將研究視角轉移到原住民身上。

詹老師說：「這是一個非常單純的起點。在來研究院前，我沒有去過任何平埔聚落，純粹就只是用歷史文獻寫論文。後來因為在研究院工作，除了原先就有興趣的人類學，也開始接觸到各種不同的學科，我才真得看到堂奧。而第一次進入平埔村落時，猛然頓悟到『喔！原來他們在這裡，他們真的在！不是都漢化了，不是都消失了！』實際回到那個歷史現場，給我很大的衝擊。」