長濱鄉

南溪國小

民國44年設立樟原國民學校南溪分教室，47年改為南溪分班，49年改南溪分校，51年獨立為南溪國民學校，57年改名南溪國民小學，102年裁撤。

長濱鄉

忠勇國小

民國38年設立長濱國民學校忠勇分班，47年改為忠勇分校，52年獨立為忠勇國民學校，57年改名忠勇國民小學， 102年8月1日裁撤。

東河鄉

尚德國小

民國46年設立泰源國校南溪分教室，48年改為南溪分班，49年升為南坑分校，50年獨立設校為南坑國民學校，57年改名南坑國民小學，60年3月17日改名尚德國民小學，88年改為泰源國小尚德分校，92年裁撤。

東河鄉

尚德國小銅礦分班

民國55年設南坑國民學校銅礦分班，71年尚德國民小學銅礦分班裁撤。

東河鄉

尚德國小七塊厝分班

民國55年設南坑國民學校七塊厝分班，82年尚德國民小學七塊厝分班裁撤。

東河鄉

隆昌國小

昭和20年（1945）設立大馬國民學校（東河國小）佳里分班，民國34年4月設立東河國校隆昌分校，35年9月獨立設校更名為臺東縣東河鄉隆昌國民學校，36年8月設立都蘭國校興昌分校，37年9月獨立成興昌國民學校，84年11月11日晚的地震使興昌國小校舍龜裂，隔天學生在操場上課，黃國明校長與教育局及隆昌國小協調並獲家長會同意，暫併隆昌國小上課與辦公，經過將近四年的一校兩制，考量學校及學生的最大利益並獲兩校家長會同意，臺東縣政府88年7月26日府教國字第095503號函核定自88年8月1日合併隆昌、興昌兩校，改校名為興隆國小，校址為原興昌國小校址，興昌校舍興建期間，暫時使用隆昌國小校舍，93年5月興隆國小新建校舍完成，93年8月興隆國小由隆昌校區遷至興昌校區。

池上鄉

萬安國小山棕寮分校

民國55年因富興村山棕寮墾荒人數增加，設立萬安國小山棕寮分班，58年改為分校，因人口外流嚴重，64年裁撤。

海端鄉

霧鹿國小下馬分班

民國57年8月設霧鹿國民學校下馬分班，76年8月霧鹿國小及下馬分班裁為利稻國小霧鹿分校及下馬分校，82年裁撤，校地歸還原民會。

海端鄉

崁頂國小紅石分校

民國53年設立設崁頂國民學校紅石分教室，54年改為紅石分班，61年改為紅石分校，105年8月1日裁撤。

鹿野鄉

寶華國小

民國50年設立瑞源國校木坑分班，51年改為寶華山分班，54年改為寶華山分校，56年8月獨立為寶華國民學校，57年改名為寶華國民小學，68年改為瑞源國小寶華分校，82年裁撤。

鹿野鄉

瑞源國小興隆分校

民國57年8月設立瑞源國小興隆分班，60年改為興隆分校，67年再改為興隆分班，69年7月裁撤。

鹿野鄉

永安國小永隆分校

民國62年設永安國小永隆分校，102年裁撤。

鹿野鄉

鹿野國民學校和平分班

大正6年（1917）設鹿野尋常小學校，設在龍田，次年改稱鹿野尋常高等小學校，昭和16年改名鹿野國民學校，臺灣光復後學校停辦。校地改建為鹿野鄉公所，民國36年和前身為鹿野東國民學校的鹿野國民學校換地，40年9月1日設和平分班，42年併入本校鹿野國民學校。民國50年因設在鹿野火車站南邊的車站分校獨立隨村名命名為鹿野國民學校，原鹿野國民學校改名為龍田國校。

延平鄉

永康國小

民國38年2月設立武陵國小永康分校，40年獨立為永康國校，42年8月與鹿野鄉永安國小合併而裁撤，55年9月重新設立永安國小永康分班，56年升為永康分校，因行政區域重新劃分改隸武陵國小，57年獨立為永康國民小學，85年降為武陵國小永康分校，96年裁撤。

延平鄉

鸞山國小竹林分班

民國60年設立瑞源國小竹林分班，63年因行政區域重新劃分，改隸為鸞山國小竹林分班，64年改為竹林分校，82年裁撤。

卑南鄉

初鹿國小山里分校

民國47年8月設立稻葉國校山里分教室，48年9月改為分校，77年嘉豐國民小學改隸初鹿國小，山里分校隨其改隸為初鹿國小山里分校，100年裁撤。

卑南鄉

嘉豐國小

民國41年成立初鹿國民學校稻葉分班，44年改為分校，46年9月稻葉分校獨立為稻葉國校，57年改為稻葉國民小學，59年改為嘉豐國民小學，77年8月，嘉豐國民小學併為初鹿國小嘉豐分校，82年7月嘉豐分校裁撤。

卑南鄉

美農國小

當地熱心教育的家長集資收購原日治臺拓會社辦事處做為校地，民國38年設立初鹿國校高台分班，49年8月獨立為美農國民學校，76年7月改為賓朗國小美農分校，次年降為美農分班，82年裁撤。

卑南鄉

富原國小

民國39年3月設立富岡國民學校杉原分班，40年1月設富原分班，44年9月富原分班改為分校，48年8月獨立設校，杉原分班61年獨立為富山國小，75年8月改為富山國小富原分校，77年降為分班，85年改為分校，100年裁撤，

卑南鄉

樂山國小

民國43年設立建和國校樂山分校，47年設溫泉及內溫泉兩分教室，48年溫泉及內溫泉兩分教室合併為建和國校溫泉分校，51年因建和國校溫泉分校獨立為臺東縣卑南鄉溫泉國民學校，改隸屬為臺東縣卑南鄉溫泉國民學校樂山分校，56年8月1日樂山分校奉准獨立設校，因學生人數逐年遞減，71年再度改隸為溫泉國小分校，73年再改制為樂山分班，82年裁撤。

臺東街

臺東國民學校

明治38年（1905）於臺東公學校設宜蘭小學校臺東分班，明治42年（1909）設立臺東尋常高等小學校，臺灣光復後被臺東縣立文化國民學校接收。

太麻里鄉

三和國小秀山分校

民國37年6月設立華源國校三和分班，43年改為三和分校，48年8月獨立為三和國民學校，校址位在半山腰的三和村，49年9月設三和國小漁場分校，53年8月漁場分校獨立為三和國民學校，原三和國民學校改名為秀山國民學校，75年8月1日改為三和國小秀山分校，77年改為秀山分班，82年裁撤。

太麻里鄉

華源國小

民國34年於設立太麻里國校杉原分校，36年3月獨立為杉原國民學校，同年秋杉原村更名華源村，校名改為華源國民學校，85年降為三和國小華源分校，101年廢。

太麻里鄉

華源國小新吉分校

民國47年8月設立華源國校新吉分班，76年8月裁撤。

太麻里鄉

大王國小森川分校

民國57年設立大王國小森川分班，61年改為森川分校，65年改為分班，69年裁併。

太麻里鄉

香蘭國小溪頭分班

太麻里鄉

多良國小

前身為金崙國校多良分班，民國42年金崙國校併入賓茂國校，多良分班改隸為賓茂國校多良分班，49年8月1日多良分班獨立為多良國民學校，原大竹國小大溪分班改隸為多良國校大溪分校，56年8月1日大溪分校獨立為大溪國校，85年8月1日多良國小併入大溪國小，成為大溪國小多良分校，88年1月1日，多良分校裁併入大溪國小。校地民國99年與清華網路文教基金會合作成立向陽薪傳木工坊推廣社會教育。

太麻里鄉

金崙國校

明治41年（1910）設立虷仔崙教育所，大正3年（1914）改為臺東廳太麻里區虷仔崙公學校，大6年（1917）改為虷仔崙蕃人公學校，大正11年（1922）再改為虷仔崙公學校，昭和13年（1938）改為金崙公學校，昭和16年（1941）改為金崙國民學校，光復後改為臺東縣金崙國民學校，民國42年金崙國校併入賓茂國校。

金峰鄉

壢坵國小

昭和2年（1927）設置チヤチヤガトアン（隻隻卡多安）教育所，昭和7年（1932）設置出水坡教育所，昭和18年（1943）將舊出水坡、新出水坡、姑子崙及隻隻、卡多安遷村至壢坵，昭和19年（1944）合併兩教育所為壢坵村國民學校，民國35年改名壢坵國民學校，57年改名壢坵國民小學，75年8月改為賓茂國小壢坵分校，82年改為壢坵分班，84年裁撤。

大武鄉

大竹國小

大正元年（1912）設置大竹高蕃童教育所，大正14年（1925）改設大竹高公學校，昭和16年（1941）改稱大竹國民學校，民國57年改名大竹國民小學，85年改為大鳥國小大竹分校，88學年度裁撤。

大武鄉

大武國小加羅板分校

大武國小加羅板分校，不知何時降為分班，民國82學年度裁併。

大武鄉

南興國小

民國48年成立尚武國小南興分班，53學年度升格為分校，54學年度獨立，77年降為尚武國小南興分校，84年廢校。

達仁鄉

安朔國小南田分班

民國44年設安朔國校南田分班，75年裁撤。

達仁鄉

森永國小

1912年12月1日設大力里克教育所，民國34年10月更名為臺東縣大武鄉大谷國民學校，35年4月成立達仁鄉改隸更名為達仁鄉大谷國民學校。43年2月全村遷居森永，校名隨村名改為達仁鄉森永國民學校。57年改稱臺東縣達仁鄉森永國民小學，84年8月，因人口外流，學生數不足，森永國小降為安朔國小森永分班，88年8月裁撤。

綠島鄉

公館國小溫泉分校

民國43年設立綠島國民學校溫泉分班，46年公館分校獨立為公館國校，溫泉分班改隸溫泉國校，60年改為溫泉分校，82年裁撤。

蘭嶼鄉

東清國小銀野分校

民國51年設立東清國民學校銀野分班， 87年裁撤。