捷運萬大線工程遭到爆料，支付工程款標準不一，北市議員周柏雅踢爆，有些廠商施工進度不到2％，卻已經領走超過11％的款項，質疑北市捷運局圖利特定廠商。捷運局澄清，依規定會有10%的預付款，讓部分廠商先支付機具和人力，但必須專款專用，訂定還款保證，可藉此讓廠商競價往下拉，反而對公部門有利。

捷運萬大線，施工努力趕進度，如今卻被爆料，北市付工程款超過工程進度，成了冤大頭。北市議員周柏雅踢爆，新亞建設施工進度13.7%，卻拿到21.3%的款項，超過工程進度，皇昌營造只有2%，卻也得7億元１成以上的工程款，反觀大陸營造，僅僅拿到３億元，反而不足工程進度，質疑是不是圖利特定廠商。捷運局被爆"太大方"，出面澄清，工程款項的確視工程進度給錢，是因為多給了廠商所謂的"預付款"，才會造成金額居然超過進度。捷運局強調，合約載明必須專款專用預防廠商拿了錢卻轉投資，在最低標的公開招標中，更可以用比較好的條件，壓低廠商競價，捷運局緊急滅火澄清絕沒有圖利。