台大醫院處理趙建銘事件，再度犯了一個大錯。」台大醫院院務會議以懸殊票數否決趙建銘復職申請案，該院外科加護病房主任柯文哲表示，台大院方先前過度容忍趙建銘，待他惹出一連串爭議後又置若罔聞，如今又不讓這個「壞學生」回到醫院接受「管教」，無異錯了第二次。
當趙建銘被控涉及種種不法情事時，他即以「反省、認錯、道歉，談趙建銘案」一文投書民生報，直指台大百年核心價值不再，竟然在權勢之前，矮了身子，失了志氣。
不過，對於趙建銘的復職申請案，柯文哲說，「如果我有機會參加院務會議，我會投贊成票。」他認為，教育的本質，在於把壞的學生教導成好的學生，也不能放棄任何一個學生。既然趙建銘曾出現偏差行為，台大實無理由置身度外，更有義務予以導正回來。
柯文哲認為，當年院方讓趙建銘破例回到台大並在短時間晉升主治醫師，就已引起側目，後來他又擁有專屬辦公室，也是院方高層縱容的結果，直到趙建銘涉及台開案等弊端，台大院方又撇得一乾二淨。直到審理趙的復職案，卻又要顧及社會觀感，把他拒於台大門外，顯然不應該。
柯文哲表示，院務會議的決定，只能說是大家被趙建銘搞煩了，只好以最簡單的方式處理，將傷害降至最低，「但最後出現懸殊票決結果，其中事有蹊蹺」。
