民進黨執政時期；2006年1月通過的水患治理“特別預算”總金額1，410億，包括；行政院「水患治理條例」800億、立法院加碼「水患治理條例」360億、「石門水庫及其集水區整治特別條例」250億。

第一期的309億在預算通過後的三個月內就交付立委。當時的行政院長蘇貞昌在2006年的3月28日赴立院報告治水計畫第一期特別預算案。蘇報告指出，總計8年的治水預算，第一期95年度及96年度特別預算編列309億6,500萬元，估計在疏濬完成後，可完成流路疏通1161公里。 

此外，對立委高度關切石門水庫淤積問題，蘇答詢時明確表示，政府將動用國軍工兵及蛙人部隊進行桃園石門水庫的清淤工程，並做好上游治山防洪工作，避免漂流木及砂石持續沖刷進入水庫。 

經過兩年，已核定的224件工程，僅31件完成。於是，在2008年6月17日水利屬重申治水的決心：「針對立法院國民黨團今（17）日上午舉行記者會，質疑治水特別預算已核定的224件工程，僅31件完成，進度嚴重落後，近日中南部因雨災情不斷，16日一場大雨立刻…」（參考水利署：易淹水地區水患治理計畫專屬網站http://fcp.wra.gov.tw/ct.asp?xItem=38135&ctNode=5281&comefrom=lp ） 

內容不外是一些原因說明，這個慎重的申明後的一年多，到底水利署又做了那些事？為什麼一個中度颱風會讓臺灣重創，讓那麼多百姓的房子倒塌、人蓄被水沖走、米椋被淹沒？！這一切的為什麼，我們不要再聽到什麼「重申」！ 

馬總統，請真正發揮政府的公權利，做到；

1.         清查這些預算的真正流向  （包括近十年的所有工程項目）

2.         請水利暑清楚的條列所有預算對應的相關工程、相關負責人還有承包商

3.         請水利暑清楚的條列所有相關工程的時間表與進度

4.         清楚條列工程驗收內容，並有公正的第三方參與，例如：民間團體

5.         明定所有的責任歸屬與獎懲（最大的負責人當然是署長，你的薪水最高當然責任最大！）

6.         將以上的內容、工程進度，透過媒體向人民報告 

1，410億是人民的血汗錢！這近10年來多少人因為貧困、失業而自殺，多少家庭因為天災人禍而破碎。政府官員是在為人民做事、謀福利，不是享受特權或藉勢藉端的搞貪汙！ 

這次的風災造成那麼多的人員傷亡，如果有貪汙或失責者，不知良心何在，應該是“殺無赦”！