日本海上防衛隊就是日本國海軍，這次對峙，由於雙方艦艇噸位明顯差一大截，海巡署未協調國防部派艦支援，可能有所疏漏，海巡署要買大船說的容易，人員訓練就是一個大問題，只不過便宜了海巡署又大量增編海洋總局的人力而已，世界上只我國和南韓的海巡是警察體系，但是南韓遇有海上事件也常由海軍直接處理，只有我國老是有門戶之見，對由海軍協助海巡乙事畏首畏尾。

世上海上強權的海巡都是海軍，美國海岸防衛隊號稱第五軍種，所用艦艇，人員訓練、服制無一不是海軍翻版，除了有一部分是公務員及聘雇人員，做的是行政工作，海上勤務根本就是「海軍」在執勤，還設有官校、士校，也都是海軍體制。

不用海軍當海巡的國家，海巡的職責也多屬導航、國境執法等服務性質，其餘海上執法也大都是由海軍全權或協助警政單位處理。

國軍想要維護海權，切割為海巡與海軍是不對的，我國應該學習美國，深植海軍戰力於海巡，平時執勤與救難，戰時納入國軍體系整補亦不會出現問題，在國防部要把救災救難列入國軍任務之一時，請國安當局再次考量，將海巡也納為國防的一部分。

由優秀海軍轉型海巡有個好處，就是人員訓練統由海軍訓練，擇優進入海巡後再施予專業訓練(如相關法律及救難、緝私、緝毒、污染防治、涉外事務等技術養成)，即可投入海巡工作，而且成員都屬壯年，面對台海海面之險惡，較有應付之體力，人員可以與海軍交流，不易形成一灘死水，大家可以想像現在進入海巡的人員，他們都要到65歲才退休，他們不退就補不了新血，全世界有那幾個國家是派老人家在海上執勤的？海巡署其餘的政治官僚、技術官僚、勤務體系，就可以用公務員、警察(屬國境警察)來任用，這樣的海巡才是真正有戰力的海巡。