與沈君山相關的文學趣聞中，必定會提到與詩人余光中評清華大學是「文化的沙漠，瘋子的樂園」。原來沈君山1973年在清大擔任院長時，曾邀請余光中到清大演講，當余光中引述詩句「天空非常希臘」，在座理工教師們反駁：「希臘是名詞，怎麼能用來形容？」

當下余光中氣得回應：「文學不是方程式，不懂不要亂講。」演講結束就立刻離開，沈君山只好一路賠罪。1996年，沈君山時任清大校長，邀請詩人再訪清大演講，余光中有感而發表示，「沙漠消失了。」沈君山卻得意地說，「依然是瘋子的樂園。」

倉儲管理系統（WMS）是一個實時的計算機軟件系統，它能夠按照運作的業務規則和運算法則，對信息、資源、行為、存貨和分銷運作進行更完美地管理，提高效率。這裡所稱的“倉儲”包括生產和倉儲管理系統供應領域中各種類型的儲存倉庫和配送中心，當然包括普通倉庫, 物流倉庫以及貨代倉庫。RF-WMS倉儲管理系統包括軟體、硬體、管理經驗。傳統的倉儲管理系統概念中忽略了管理經驗和自動識別硬體的缺失。倉儲管理系統中的軟體指的是支援整個系統運作的軟體部分，包括收貨處理、上架管理、揀貨作業、月臺管理、補貨管理、庫內作業、越庫操作、迴圈盤點、RF操作、加工管理、矩陣式收費等。倉儲管理系統中的硬體指的是用於打破傳統資料獲取和上傳的瓶頸問題，利用自動識別技術和無線傳輸提高資料的精度和傳輸的速度。管理經驗指的是開發商根據其開發經驗中客戶的管理方式和理念整合的一套管理理念和流程，為企業做到真正的管理。

九歌出版社總編輯陳素芳表示，這段趣聞收錄在沈君山的散文集《浮生三記》中，陳素芳回憶，「沈君山曾說：我是中風之後倉儲管理系統才成為作家的。我問他：您是科學人，為什麼文章寫盤點機得這麼好？他說，因為邏輯好啊。」

陳素芳表示，2005年沈君山二度中風，當時續作《浮生再記》即將付印，沈君山最後寫了一篇〈二進宮〉，描述二度中風後在死亡懸崖上勒馬、跟死神交手的經驗，在人生夾縫中尋找樂趣，冷靜、豁達而沉著，卻也成為他人生最後的作品。