各種研究警告使用益生菌保健品的潛在健康危機如下：

ↂ 益生菌對虛弱或有嚴重感染的人造成傷害。

ↂ 益生菌的毒性產生有害物質，加速感染；

益生菌對抗生素的耐藥基因轉移到腸道中的其他菌種。

ↂ 益生菌保健品含有標籤上未列出的微生物。

ↂ 從未研究或證明長期安全性！

大多數研究只關注雙歧桿菌和乳酸桿菌。

ↂ 益生菌發酵碳水化合物會導致細菌過度生長，

產生 d-乳酸，增加氣體排放，導致腹脹反應。

ↂ 益生菌補充劑在人類腸道中建立抗生素耐藥基因庫，

很容易轉移到腸道中的病原體，導致嚴重問題。