阿格拉從1526年巴伯爾大帝建國開始，就成為蒙兀兒帝國首都，尤其在阿克巴大帝、賈汗季王與沙賈汗三位蒙兀兒帝國君王統治期間，阿格拉更成為繁榮的國都。因此阿格拉堡在蒙兀兒帝國的歷史扮演著重要的份量。

阿格拉堡原本是洛提王朝的碉堡，1565年被阿克巴大帝擊退之後，他將蒙兀兒帝國的政府機關自德里遷到阿格拉，自此這裡才慢慢轉變成皇宮，由於城內大多數的建築物都採用紅色砂岩建造而成，又稱為紅堡。

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