公元2000年，因國民黨李登輝執政下，黑金共治，貪腐頻傳，諾貝爾獎得主李遠哲登高一呼：向上提升或向下沉淪？萬民期待一個打擊貪腐、為民除害的英雄出現，老百姓於是用選票讓政黨輪替，民進黨陳水扁當選總統，展開台灣新頁。

四年後，貪污未減，黑金依舊，再次總統選舉，319案兩顆子彈改變民調支持結果，讓陳水扁再次當選，接著的四年貪官污吏變本加厲、賣官、賣國產、賣建設案、賣開發案、賣公營行庫、賣公營事業土地、能賣的都賣了，扁家財富極速累積，三級貧戶變台灣首富；蚊子館到處林立、外債也逐步高升；全球景氣大好，百姓貧富差距也大增；富人財富更多，老百姓卻一個個淪為卡奴；富豪到處購置豪宅，百姓卻全家燒炭自殺。

2004年作弊的選舉引發民怨，為了公義、要求調查319案真相而站上街頭的老百姓，沒有得到重視，卻遭到警方的強力驅離，公權力沒為正義伸張，卻淪為貪腐者迫害百姓的工具，2005年12月，陳金珠不惜犧牲自己生命，向蒼天死諫，要求公理正義的審判，2006年6月，歷經半年曝曬的白骨及露台上的人形痕跡才被發現。

在此同時，扁家女婿趙建銘爆發台開案、吳淑珍扯上SOGO案，李麗芬拿出發票揭開第一家庭貪污國務機要費的序幕，邱毅不斷揭發扁家各項貪污的事證，民眾要求罷免呼聲四起，罷免案卻一再被阻撓，民怨沸騰到高點。

2006年8月12日，施明德在二二八公園召開記者會，宣佈號召每人100元，募集1億元資金，展開「愛、和平、非暴力」的倒扁訴求，開始坐上街頭，要求陳水扁下台，會後跪下祈禱，祈求上蒼的保佑。

短短一週內資金順利募集完畢，立刻關閉帳戶，謝絕捐款，9月9日正式展開倒扁行動，要求以紅衫穿著，被冠名：「紅衫軍」。

行動開始，數十萬人上街，連續兩天遊行納斯卡線，並在凱達格蘭大道上展開24小時長期靜坐，與政府對峙，期望用人民站上街頭和平靜坐的訴求，迫使貪腐的陳水扁認錯下台、接受司法審判。

無恥的陳水扁並未因此自省，民進黨更是傾全力來阻撓行動，9月16日故意申請凱道舉辦活動，迫使紅衫軍移轉台北車站，9月15日反貪腐總部決定以「螢光圍城」遊行，將隊伍擴大遊行區域，繞行總統府一圈再走向台北車站，當天下午民眾不斷集結，遊行被迫5點30分提前展開，長達七小時餘的遊行隊伍、人數超過75萬人以上，許多人推著輪椅、娃娃車加入遊行行列，整個台北西區，被螢光棒照亮夜空，老百姓展現最理性民主的表現，創下歷史上夜間遊行人數最多、遊行時間長、過程完全和平、並順利將群眾帶往台北車站的紀錄。凱道也在義工規勸安撫下，所有民眾都配合離去，順利清空場地，還給市政府。

9月20日，再次取得凱道的使用權，夜間開始移動，為避免吵到附近商家，採用全程靜默的行動，再次遊行將民眾帶回凱道，民眾也展現超強配合度，沒人高聲呼喊口號，連隨行小狗都靜默無聲，順利帶回凱道，次日是921地震七週年，學生展開921分鐘跪地為台灣祈福的行動，靜坐會場並點燃燭火，為台灣禱告。

9月28日民進黨再一次申請凱道成功，迫使紅衫軍再次移至台北車站，這一次紅衫軍決定不再沉默，27日晚上以最大的音量呼喊口號，再度重回車站。

不斷地遷移，讓倒扁基金消耗許多搬遷費用，總部決定就固定於台北車站前，不再遷移。資金的耗損，也讓許多關心的民眾，擔心倒扁基金不足，紛紛表達欲再次捐款的意願，但皆被拒絕，總部公開謝絕捐款，只接受物資的捐贈，每天萬餘名的倒扁群眾，食物、飲水的需求量大，捐贈的物資讓民眾能無食物匱乏，專心靜坐，表達訴求。

在民進黨的阻撓下，反貪腐總部決定展開環島反貪腐訴求，希望紅衫軍遍地開花，9月29日十餘部遊覽車及上百部自用車開始出發，展開為期八天的反貪環島之旅，沿途經過民進黨縣市長治理的嘉義縣、台南縣、台南市、高雄市、高雄縣都遭到拒絕入境停留，言論自由完全被遏制，號稱民主進步的政黨，卻完全用蠻橫專制的行為對待反貪腐民眾，沿路上許多民進黨支持者亦丟擲石塊，攻擊遊行車隊，迫使許多自用車為求自保，決定放棄行程離去。

雖然一路艱辛，環島之行在民進黨抵制下仍順利完成。10月10日國慶日，展開第二波大規模的遊行，總部決定再次將整個總統府周邊包圍，讓民眾的「陳水扁下台」口號，能傳遍整個國慶會場，用輿論的壓力，促使執政者認錯下臺。

自9月9日至今，已倒扁長達32天，行動當天，因範圍更形擴大，人數並未如預期增加，自早上8時直至下午14時順利繞行一圈回到台北車站，此時傳來總統府周邊拒馬會製造一處空檔，可以讓挺扁民眾一推就倒，攻入總統府內。

總部指揮群分裂，主戰派建議再次遊行攻入府內、主和派反對，最後交由施總指揮決定，施明德長年爭取民主，甚至為此坐牢長達25年，不願意辛苦爭取而來的民主，卻毀在自己的手上，讓和平的遊行，以暴力收場，讓善良無辜的百姓陷於暴亂的前線，故決定將遊行隊伍再次帶開，改為忠孝東西路的遊行，讓暴力的陰霾消散，以維護號召而來，扶老攜幼民眾的安全。

下午16時餘，遊行再一次展開，往東區前進，沿途民眾仍展現高度的守法秩序，由於警察未即反應，許多路口都不及交通管制，民眾自動自發配合紅綠燈行進，繞行忠孝東西路，並在敦化南路口暫緩遊行，讓民眾晚餐，後來回轉，至SOGO前面，靜坐十數分鐘，諷刺吳淑珍的禮券、發票，再順利返回台北車站，此時，總部宣布於忠孝西路上坐下，決定用佔據忠孝西路的手段，製造更大的壓力來迫使陳水扁下台。

隨著時間的流逝，遊行隊伍人群也漸漸散去，忠孝西路上愈來愈多的馬路空出來，紀律服務員只好請民眾不斷往前集中，總部請在場民眾盡量打電話呼朋引伴，卻徒勞無功，凌晨時分，忠孝西路西往東方向的馬路上，早已稀稀落落的民眾，總部看人群漸漸流失下，為了未來能繼續車站的靜坐行動不被禁止，只好改變策略，要求民眾配合回到車站的據點，不再佔用馬路，然而，近百名民眾，決定不再配合總部的指揮，繼續靜坐到底。

此時警察也已決定展開淨空馬路的行動，由於台北市政府為國民黨馬英九所管轄，中央為強力驅逐，不惜調動中南部的警力，連夜北上。凌晨四時，展開驅離行動，上百名民眾將手相扣形成人牆防禦，由於警力徹夜未眠，為避免將怒氣發洩於百姓之上，一名女子(未經允許，名字暫不公佈)不顧自身安危，勇敢在最前線跪求警察不要暴力相向，警方最終以柔性驅離，將民眾一一架離現場，送上警備車離開，將道路淨空，讓上班車潮不受影響。

10月11日凌晨的驅離，反貪腐總部指揮群未在前線堅守，讓民眾對總部失去信任感，民怨轉向總部，倒扁群眾大量流失，總部於12日晚間宣布紅衫軍暫時退潮，留下總部群繼續靜坐，靜待檢察官起訴，車站人潮快速減少。

11月3日星期五，倒扁第56天，陳瑞仁起訴吳淑珍等四人涉嫌貪污國務機要費，車站再次擠滿人潮，總部當晚決定再度前進凱道，期待利用三天假日的時間，將凱道坐滿人潮，以群眾力量，配合司法起訴，將陳水扁壓力拉到最大，再度迫使他認錯下臺，面對審判。

11月4日凌晨，人潮未如預期湧現，隨著時間流逝，群眾更加稀疏，總部所有指揮群全部堅守現場，但是紅衫軍早已不知去向，凌晨四點，殘留200餘人，已經無法繼續靜坐凱道，鎮暴部隊再次集結，所有民眾集中，寧可被驅離，也不願自行解散，在柔性驅離下，再次潰散，重回車站。

天氣陰雨綿綿，氣溫也愈來愈低，車站的人潮及媒體也早已消失，剩下數百名民眾堅持，空曠的場地，面對著遲遲不肯下台的陳水扁，反貪腐總部決定尋找室內場所，做長期的抗爭，在默默尋找地點、裝潢之後，11月29日，倒扁第82天，結束戶外的抗爭，轉向總統府斜對面50公尺處的重慶南路一樓店面，裝潢成紅衫軍之家，讓民眾就近總統府，成為陳水扁如梗在喉的芒刺，施明德也在幹部建議下，展開自囚，由於身體罹患肝癌，在醫生建議下，於原來的濟南路反貪腐總部處改建為自囚場所，展開另一階段的反貪腐行動。