違法的農地工廠，政府給予輔導大限明年六月二日到期，擔心可能有上千家違規工廠難以在期程內完成合法化程序，傳出政府有意延長輔導期，讓它們盡量有條件就地合法。經濟部長沈榮津上午指出，行政院會找相關部會保健食品代工協商，登記納管的方向不變，凝聚各部會共識後提出修法。

全台違法的農地工廠總面積超過1萬公頃，除了上千家領有臨時工廠登記證的廠商，經濟部內部推估可能還有數萬家廠商的黑數。農地工廠的輔導期到明年六月二日，已有環保團體發現最近地方縣市出現搶建違章工廠的現象。

違法農地工廠的輔導與管理顯然已成為燙手山芋，傳出有民進黨立委向院長蘇貞昌陳情，盼延長輔導期限且擴大輔導對象，同希望經濟部不要訂出落日，以利現有的農地工廠可以持續營運緩步合法。

隨著科技的進步與發現、以及國外資訊的流入，很多過去沒有的產品或不知有保健功效的產品，陸陸續續被發現有保健功效，而被國人使用為保健食品，最顯著的是十字花科蔬菜如青花菜、高麗菜有抗癌作用；大蒜、葡萄、茶（兒茶素）及蕃茄（茄紅素）有抗氧化功能，已近年國人十大死亡原因首位癌症而言，植物中許多化學成分，堪稱為21世紀之維他命，對癌症有多重之保護效果，鑑於台灣四季盛產蔬菜水果，除鼓勵民眾養成多攝食蔬果的良好習慣外，未來利用含有豐富營養成分的蔬果及現代化科技，研發成生機蔬果汁、糙米茶及蔬菜湯等天然保健食品，不啻為既可提供國人有益健康之產品，又可提昇蔬果產業之發展。

經濟部長沈榮津指出，違法的農地工廠，行政院的態度很明確就是不許新建，既有的則須登記納管，行政院目前將請各部會一起研商凝聚共識，提出法案送審。沈榮津說：「院裡找各部會談希望凝聚共識後提一個院版，送到立法保健食品代工院修法」。

其實經濟部內部一直以來就是傾向有條件就地合法，違法工廠如果符合低汙染、無公安疑慮、合法經營三大要件，並繳交一定的回饋金，在申請「特定工廠登記證」後合法。