慈濟官方網路公告的資料中，八八風災以及南亜海嘯專案賑災款項是有被挪用到其他項目，可是慈濟卻在事後以公益勸募條例申請變更用途。如下：

南瑪都風災等災難支出 2213萬。
澎湖空難及高雄氣氣爆支出 3669 萬。
南亞海嘯專案賑災款項有其他援助項目如下：...
北朝鮮糧荒援助 2.85 億。
大陸地區援建平房等急難救助 2.97 億。
其他國家賑災支出 13.35 億。