為凸顯中華民國的主體性，弱化日本統治色彩，台鐵對於日本時代所興築的鐵路，均以「光復前台灣鐵道部」稱之，且年號皆使用民國紀年。例如，「基隆—台北（雙線）光復前台灣鐵道部 民國八年（一九一九）至民國元年（一九一二）添築雙線」。參觀民眾都感到疑惑，怎麼年代的前後順序放反了？是印錯了嗎？整張地圖的年代，統統都是前後相反，不管是日治時期還是民國時期。

李筱峰指出，從現在回推一百年，就台灣這塊土地來看，是由日本所統治；從中華民國來看，卻正在推翻滿清政府。若硬要把台灣這塊土地的歷史套上中華民國框架，大吃歷史的豆腐，就會出現這種弔詭、不合史實的怪象。

對於這項由國立台灣博物館策劃的展覽，竟出現這種基本又不合常理的錯誤，李筱峰直言，不夠專業。

台鐵局長范植谷表示，引發質疑的「台灣鐵路路線發展圖」圖面和文字很滿，資訊太多，有可能因此在時間序列的呈現上，為節省文字說明，才發生這樣的情況，但滿清政府和日治時期的文字都沒有少。

范植谷說，由於該展兩個月前才標出開始策劃，台鐵局歡迎民眾和專家提出專業意見進行調整，台鐵將主動連絡李教授，請他提供建議，也會反映問題給台博館。

對於被質疑展覽欠缺台灣主體性，范植谷指出，文物展首重是還原史實，沒有其他考量。