劇情簡介:
世界上最美麗的城市-水之都，小智一行人在那裡遇見了擁有不可思議力量的神奇寶貝，牠們在這個城市裡守護著傳說中的寶物-【心之水滴】

有兩個世界級的怪盜，看中了心之水滴，並且以這為目標來下手，隨著心之水滴所隱藏的封印即將被解除、城市將被大洪水吞沒了！小智和皮卡丘有辦法平安的渡過危機嗎？