深坑古厝依建材不同，分為四種型式：石厝、土厝、土埆厝、紅磚大厝：前三種古厝因建材不易保存，故現存古厝多為磚建厝。

紅磚大厝下部以砂岩鑿成石條堆疊做為基石，上半部則用紅色薄磚砌成中空半形的「斗子牆」，中間填入土埆，牆壁的厚度在三十公分以上，加上厚重的門閂，入口以石條鋪地，防止匪徒挖開地面鑽入，如永安居 ，興順居。

深坑古厝的整體外型，多以三合院為主，屬於「火庫起」的建築構造。「火庫起」是指屋身正面頂部逐層向外出挑，以支承屋檐之屋身。屋身以紅磚為主要建材，以利防禦及防火，正身成三間或五間起，左右有護龍伸出，形成三合院，若人丁旺時，還可再向左右建外護龍（如福安居、德鄰居）。整個三合院中，以正廳的屋頂最高，向兩側及左右護龍逐厝下降，因正廳通常供奉祖先牌位，為全家族的精神中心，象徵長幼有序的倫理觀念。

 

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古厝最美的地方在於屋頂的表現，屋頂上最高水平線的屋脊稱為「正脊」，有大脊及小脊之分：「大脊」，指上有縷空花磚、貼彩色磁磚或交趾燒圖樣者，多用於正身（如永安居、興順居）；「小脊」，則是實心方形，單純無華著，多用於護龍或一般較普通的古厝。正脊的左右端為「曲脊」，曲脊有三種表現型式，燕尾、馬背、瓦鎮，而深坑現存古厝又以前兩者居多，在此稍做說明：

一、燕尾：是正脊的左右側曲線向上揚起，尾端分叉為二支如燕子尾巴，通常代表主人具有官品或顯赫社會地位，如永安居、興順居。

二、馬背：曲脊部份呈現馬背狀，工匠師傅會依風水需求或個人喜好而狀馬背的造型加以變化成「金形圓、木形直、水形曲、火形銳、土形方」五種形式。

深坑古厝還有一特別之處，即有錢宅第常具有防禦土匪或原住民侵擾的設施，早期先民散居丘陵或平原邊緣，為防範盜匪打劫，常在牆面挖槍孔（外細內寬的三角柱體），如永安居；或是建二層樓瞭望避難的統櫃（槍樓）上層牆厚窗小，四周牆上設有槍孔，聯合各槍眼的弧形射程範圍，可使石厝的四周形成一片火網，阻擋盜匪侵入，如黃氏古厝、福安居。