財政部北區國稅局表示，營業人自動向稅捐稽徵機關補報並補繳所漏稅款者，凡屬未經稽徵機關或財政部指定之調查人員進行調查之案件，免予處罰。

所稱「進行調查」之調查基準日，係指（一）函查日：發函通知營業人限期提供帳簿憑證備查，確認違章事實者，以函查日為調查基準日。（二）調卷或調閱資料日：經調卷或調閱相關資料，即可查核確認營業人涉嫌違章事實者，以調卷或調閱相關資料之日期為調查基準日。故違章漏稅案件，經有權處理機關主動查覺或查獲者，即不適用稅捐稽徵法第48條之1補稅免罰規定。

該局舉例說明，甲係使用統一發票之營業人，97年8月9日與地主乙簽訂合建分售合約書，由甲出資興建並銷售房屋，乙出售土地。甲於100年4月7日與承買人丙訂立房屋買賣契約，出售系爭房屋，議定房屋總價款為8百萬元，並於100年4月29日移轉所有權予丙，嗣100年8月27日國稅局發函進行調查，甲旋於同年10月1日補開立發票及補繳營業稅，並於100年11月15日將補開立之二聯式發票逕申報於營業稅申報書。惟查甲雖已辦理補報及補繳營業稅，然均係於本件調查基準日100年8月27日確立後之行為，不符稅捐稽徵法第48條之1第1項「未經稽徵機關或財政部指定之調查人員進行調查」規定，是無自動補報補繳免罰規定之適用。

該局特別提醒，納稅義務人如有短漏稅捐情事者，應儘速在未經稽徵機關或財政部指定之調查人員進行調查前，自動向稽徵機關補報並補繳所漏稅捐及加計利息，以維自身權益。