海軍總部於96年2月在原海軍第四造船廠營區興建海軍第11、12號軍用碼頭；97年5月底完工，同年11月驗收，承包商樺棋營造早已領完工程款。但工程期間，造成鄰近民房龜裂，漏水，加上噪音，嚴重影響居民生活。

實踐里約二百多戶居民，當時有卅三戶里民曾具體簽名陳情及附部分損害民舍照片，透過某民代陳情處理，但海軍方面表示未收到相關陳情資料；海軍及廠商至今都強調當時只受理到一戶里民申訴案。目前受害居民正籌組自救會，也向行政院南部中心陳情。

7日於旗津召開的協調會，居民群情激憤，怒責包商及海軍忽視居民權益。碼頭工程施工期間，曾陳情包商、民意代表反映不滿心聲，結果多石沉大海，不了了之。我們花費約一小時觀看實踐里居民提供的180戶民房牆壁龜裂、受損等照片簡報，他說，民房龜裂較嚴重是靠近碼頭處30多戶，顯示一致性外，如之前已有獲受理的一戶被確認，則鄰戶地區龜裂情況應可相對確認。

廠商對已完工三年工程，是否造成民房龜裂，堅持應有法定鑑定結果，並指當初如真得很嚴重，海軍相關營區早就被民眾「掀翻了」，此說引起居民一陣譁然，罵聲連連；居民要求理賠，廠商則不願理賠；廠商應拿出誠意，請示公司高層盡快確認理賠，解決問題最重要。