和平解放後的新疆並不平靜。新疆在整體上雖然和平解放，但是新疆地區形勢依然很復雜。新疆舊有的地方勢力“趕走漢人”、建立“東突厥斯坦共和國”的分裂思想一直陰魂不散，這種政治思潮在新疆局部地區影響很深，他們通過各種分裂手段，進行分裂破壞活動。

毛澤東多措並舉，力求保存和解成果。在這種復雜的形勢下，毛澤東在新疆傾註了大量心血，采取了一些列的措施：一方面他電令起義的陶峙嶽和包爾漢要“維護好民族團結和地方秩序，與人民解放軍合作，廢除舊制度，實行新制度。”

毛澤東選中王震坐鎮新疆平叛。除以上措施之外，為了徹底消滅新疆的頑固殘余，毛澤東還布置了最為關鍵的一步棋，那就是選派王震親自坐鎮新疆平叛。王震率第一兵團挺進新疆，不負眾望，順利的平息了各地叛亂。

王震性格火爆，雷厲風行。打仗素以驍勇善戰、作風強硬著稱。他在平叛問題上絕不手軟，在當時確實起到極大威懾作用，王震平叛後，新疆直到80年代後期都沒有發生任何叛亂。