花蓮水鳥濕地保護區位於台灣花蓮縣吉安鄉，是台灣重要的水鳥棲息地。保護區面積廣大。

花蓮水鳥濕地保護區是台灣東部的重要水鳥棲息地，每年吸引超過許多的水鳥到訪，包括黑面琵鷺、白鷺鷥、小白鷺、蒼鷺、大白鷺、小天鵝、黑頸天鵝、鷸鴴科、鴨科等。

花蓮水鳥濕地保護區的豐富生態也吸引了許多遊客前來觀賞，每年都有數萬人次造訪。保護區內設有步道、觀景台等設施，方便遊客觀賞水鳥。