方文山在傳統家庭中長大，求學時也有過叛逆期，與眾不同的是，他透過文字釋放情緒：「以前讀私立高職，每個學生都要寫週記、寫書法，我覺得老師一定不會仔細看，書法課我就在（作業本）寫別的語言上去，因為我對文字很有興趣，我就寫泰文或日本的片假名，我覺得老師改作業時一定只會看第一頁。」偶然被發現才被罵一頓。

爸媽不要求孩子們課業名列前茅，只希望兒女品格端正，某次大考，方文山考了全班第6名，竟一度被懷疑作弊，他笑說：「因為我每次成績都很後面，突然考這麼好，我媽很疑惑啊，好好笑，害我遭受莫名壓力，連我自己都好心虛。」媽媽當時還特別準備禮物鼓勵他，「我媽說『買一顆蘋果給你』，可是我從小就沒有很愛吃蘋果」。

爸媽對孩子的愛不習慣說出口，而是訴諸行動表達，方文山理解父母苦心，對於自己11歲兒子的教養方式也有所不同，「世代不同了，我跟兒子的相處，跟我和爸爸很不一樣，以前那個年代的爸爸不會去抱兒子，我爸那個年代比較嚴肅，爸爸抱我還會以為怎麼了、爸爸是不是生意失敗，會緊張一下，但我現在會每天都把我們家小朋友拉過來抱一抱」，把愛說出口，緊繫父子感情。

方文山到台北發展後，每個月都會固定抽出時間回桃園陪伴爸媽，「因為我爸媽吃素，就會擔心他們營養夠不夠，常添購保健品給他們每天吃」，母親10多年前過世後，他更珍惜與親人相處的時間，「其實老人家要的就是孩子平安生活，爸媽不會直接說出口，但只要知道我們工作順利就好」。