南科車站位於臺南市新市區，為臺灣鐵路管理局縱貫線的鐵路車站，是台鐵第一座太陽能車站。副站名為台南科學園區。本站設計之初，即配合南科太陽能產業，以太陽能作為電力來源，是台鐵首例。

岸式月台兩座，車站採用跨站式站房，並使用太陽能板供電。

目前為簡易站，並指定由善化站管理。部分沙崙線列車營運區間為南科－台南－沙崙。營運區間暫以此站為起／終點。

臨時站時期

僅以鋼骨與鋼板所建造的臨時月台，無站房，在台灣燈會期間辦理客運時，本站由善化站指派站員售票。北上旅客需購買至善化站；南下旅客需購買至新市站，主要停靠車種為區間車與普快車。往來兩側月台，需利用西拉雅大道陸橋附設的人行天橋。

歷史:

南科車站在臺鐵捷運化的增設車站中，屬於後續計畫。但由於當地舉辦2008年臺灣燈會、以及疏解南科聯外運輸，在臺南縣政府要求下提前設站，並由縣府墊付工程款。然而由於時間急迫，於2008年先設燈會臨時站，僅有鋼構月台。燈會結束後，改建為正式站。

2008年1月18日臨時月台開工，由於臨近南部科學園區，故命名「南科」。2008年2月20日臨時站啟用，等級為招呼站。2008年3月3日台灣燈會結束，臨時月台停用。2009年1月9日車站工程動工。2010年1月車站工程完工，升為簡易站。2010年7月14日正式啟用，並發售通車紀念車票。

臺灣鐵路環島之旅-西部幹線 (屏東→基隆)/南部部分(屏東→嘉義)