嘉義車站位於嘉義市西區，為臺灣鐵路管理局縱貫線、林務局阿里山森林鐵路-嘉義火車站-阿里山的鐵路車站，早期亦為兩條糖業鐵路嘉義線（嘉義─北港）-1982年8月17日結束客運、朴子線（嘉義─港墘）-2002年7月1日停閉的嘉義站，但目前糖業鐵路皆已廢止。現今的臺灣鐵路管理局嘉義後站即為早期糖業鐵路車站的站址，因擴充興建嘉義市先期交通轉運中心之故，旅客須可利用站內地下道或站外天橋方可到達嘉義後站。
在嘉義鐵路高架化完工前，嘉義市政府無法設立永久性質的交通轉運中心，故將臺灣鐵路管理局嘉義後站擴充，興建與其共站，臨時性質的嘉義市先期交通轉運中心。嘉義市先期交通轉運中心已於2010年2月完工，並於2011年1月20日啟用，分為前後棟，其間以天橋連接，共有15席月台供公路汽車客運業者使用，其地下1層設有停車場，計有65個小客車席位供來客使用。嘉義市先期交通轉運中心第一月台、第二月台專供嘉義公車捷運使用，為嘉義BRT臺鐵嘉義後站。
月台配置：島式月台、岸式月台各一座。
臺鐵車站（非管制區）：分為前站及後站；前站直接與月台區相通，後站則與嘉義市先期交通轉運中心共站，需經由站內地下道或站外天橋才能到月台區（嘉義市先期交通轉運中心後棟）乘車，目前計畫改建成高架車站。
阿里山森林鐵路車站：使用臺鐵第一月台北端東側上下車，並無獨立設置之車站。
旅遊服務中心：位於前站大廳左側。
月臺配置
| 阿里山 | 林鐵 | █ 阿里山線（上山） | 往 阿里山 方向 | |
| 1 | 1 | █ 西部幹線（下行） | 往 臺南、高雄、屏東 方向 | |
| █ 南迴線（直通下行） | 往 臺東 方向 | |||
| 2 | 無月台 | |||
| 3 | 2A | █ 西部幹線（上行） | 往 彰化、臺中、臺北、基隆 方向 | |
| █ 東部幹線（跨線下行） | 往 宜蘭、蘇澳、花蓮 方向 | |||
| █ 西部幹線（下行待避） | 往 臺南、高雄 方向 | |||
| 4 | 2B | █ 西部幹線（上行待避） | 往 彰化、臺中、新竹、臺北、基隆方向 | |
| █ 西部幹線（上行始發） | 往 彰化、臺中、新竹、臺北、基隆方向 | |||
| █ 西部幹線（下行始發） |
往 臺南、高雄 方向 |
歷史
1902年4月20日設「嘉義驛」。1912年銜接阿里山森林鐵路-阿里山。1933年6月車站本體改建。1942年嘉義-民雄間雙線完工，兩站相距9.3公里，中間無號誌站。在臺中線新三義隧道完成以及嘉北車站啟用之前，為西幹線站間距離最遠之兩站。1988年林宗正牧師率領數名原住民青年以電鋸拆毀站前的吳鳳銅像，使「吳鳳神話」開始破滅。1995年嘉義機務段設立南部通勤電車保養基地。2007年1月5日：配合臺灣高鐵通車，嘉義公車捷運開始行駛。2013年9月30日啟用多卡通刷卡機。
