「反走私、反偷渡、反滲透」

官士兵臂章：中央圖樣取自中國上古時代，曾幫助軒轅黃帝擊敗蚩尤的一頭黃金雙翼神龍，稱為應龍。據中國古籍《廣雅》記載：『有鱗曰蛟龍，有翼曰應龍，有角曰虯龍，無角曰璃龍

1992年－2000年期間，專責維護台灣本島與離島地區海岸線國防與治安的部隊。關於2000年－至今，專責維護台灣本島、離島地區，以及外島地區海岸線國防與治安的部隊，現為「行政院海岸巡防署」。

海岸巡防司令部，簡稱海巡部，全銜台灣軍管區司令部暨海岸巡防司令部，前身為台灣警備總司令部，現已併入行政院海岸巡防署，為海岸巡防總局的前身。由於，台灣擁有綿延1140公里的海岸線，極易遭受敵人與不法份子從事走私、偷渡、滲透，以及其他陰謀破壞的活動，故需透過專責的軍事機構從事『反走私、反偷渡、反滲透、反突擊』的任務，部內官兵則戲謔加上第五任務「反督導」。簡而言之，海巡部即為專責執行海岸巡防任務的特殊軍種。

海巡部編組基本上繼承警總，以「忠愛」為軍風，制度面也是以警總為骨幹。另一些有意思的歷史痕跡，如位於海巡部時期位於壽山的臺南師管部（原南警部），使用的餐具均有「警總」刻字，又行政的預算經費中，撥與情報、作戰部門的經費有「山海防費」項目等。部分單位的裝備，尚留有海軍陸戰隊或是憲兵的字樣。雖然如此，在草創初期，由憲兵移編海巡官兵的人員，基於情感因素多半仍自詡為憲兵，同樣的情感因素也出現在海軍陸戰隊、警總移編的官兵，三者之間格格不入，但不久之後開始有「被憲兵拋棄」、「被海陸拋棄」想法在基層流傳，「一日憲兵、終生憲兵」、「忠貞」成為他們（特別是移編初期的志願役官兵）心中莫名的價值衝突。直到移編為海巡署前夕，海巡士官兵無論志願義務，對於憲兵始終有難以名狀的仇視，在各自任務領域之內，以任務之名互起衝突的狀況時有聽聞。

1965年，台灣警備總司令部、台灣軍管區司令部接替中華民國陸軍執行海岸巡防任務，統籌指揮台灣海岸線的警戒與檢查。

• 1992年7月，國防部配合動員戡亂時期臨時條款終止之後，正式裁轍掉台灣警備總司令部。同年8月1日，重新整編憲兵、陸軍，以及海軍陸戰隊的調整，合併成立海巡部與地區海巡部，接替海岸巡防的任務。

• 1992年11月1日，國防部核定「台灣軍管區司令部」刪去台灣二字，更名為軍管區司令部，全銜「軍管區司令部暨海岸巡防司令部」。此單位為參謀本部直屬單位，不隸於陸海空軍，又由於警總早期作為協調的龍頭地位、以及海巡成軍歷程，與憲兵關係甚深，首任海巡司令王若愚即為憲兵司令出身，因此海巡部的軍風、執勤、訓練以及作戰有很濃厚的憲兵味道。

• 1997年海巡部頒布作戰訓令第一號。這也是海巡部成軍以來首次頒布正式作戰命令，內容為配合警察單位 0414 專案，也就是當時轟動一時的白曉燕命案，緝捕在逃的三名嫌犯陳進興、林春生、高天民，責成各地海巡部隊開火權限及交戰規則，若三名嫌犯偷渡出境，則該地區海巡部隊主官管以「作戰失敗」連坐三級、移送軍法審判。為此命令，各地海巡部隊開始調整勤務規劃，與警方的漁港分駐所積極配合展開漁船出入境安檢工作，並強化在海岸的電子監控、埋伏哨兵、機動巡邏頻率與火力。該年六月之後由於嫌犯逐一死亡、或被追捕，行跡已經被警方鎖定，因此作戰規劃強度逐漸下降，至陳進興落網後正式結束軍事部署。

• 1999年因港口安檢任務需求再移編憲兵224、241營。

• 2000年1日26日，立法院通過海岸巡防法，改革過往權責分散在國防部、內政部，以及財政部的海洋相關事權。從此，軍管區司令部、海岸巡防司令部，正式分置為獨立機構。

• 2000年2日，結合軍、警、調的系統，整合國防部、內政部、財政部的資源，統籌海岸巡防司令部、海軍陸戰隊、憲兵、陸軍、關稅總局、水上警察局、空中警察隊等等，成立行政院海岸巡防署。

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