綏靖區司令部簡稱綏區，是在作戰區域或接近作戰地劃成若干綏靖區，設綏靖區司令部和司令官，置於各剿匪總司令部或綏靖公署管轄下，獨掌該區域黨、政、軍、特大權。1946年9月16日，中華民國國防最高委員會於第207次會議通過綏靖區施政綱領及施政之四項辦法。在第二次國共內戰時期，國軍在各地先後成立。

1946年10月21日，行政院成立綏靖區政務委員會，專司綏靖區各項工作；又制訂綏靖區綏靖法規，共八條。11月9日，綏靖區難民急賑總隊成立。各綏靖區司令部內設機要室主任；總務處，處長羅永宜；第一處（人事處）；第二處（督察處）；第三處（作戰處）；第四處（後勤處）。1947年3月20日，台灣警備總司令部將台灣省全省分為7個綏靖區，分區清查戶口，辦理連保。4月23日，行政院公布修正《綏靖區土地處理辦法》第七條條文：綏靖區內之農地，經非法分配者，應由縣政府依本辦法徵收之。4月29日，行政院又決定：「綏靖區內農地，經非法分配者，應由縣府徵收，其地價應依法估價，折合農產物，由中國農民銀行發行土地債券，給予合法所有人，分年償付。該債券以農產物為本位，償付期不得逾十五年。」

各綏靖區司令部

第一綏靖區

第二綏靖區

第三綏靖區

第四綏靖區      

第五綏靖區

第六綏靖區

第七綏靖區

第八綏靖區

第九綏靖區

第十綏靖區

第十一綏靖區

第十二綏靖區

第十三綏靖區

第十四綏靖區

第十五綏靖區

第十六綏靖區

東北行營各綏靖區

1951年8月14日，《修正實施救災準備金暫行辦法》及《綏靖區施政綱領》公告廢止。